云莲寺创建于明崇祯十七年(1644年)， 至今已有357年的历史。其时清兵攻掠江南，战乱频仍，海奉瘟疫流行。开山祖师比丘尼玄云法师结庐弘法，在山中采药悬壶济世，为民消灾解难，至清康熙七年圆寂葬于寺后山腰。清道光十 年(1830年)， 由郑嘉柏等义举重修庵寺，留下碑记为证。国内革命战争时期，该寺是革命武装活动的基地，1934年毁于战火。 1993年冬，经上级批准，由居士郑炎华等策划复建云莲寺。在广大信众和海内外人士的鼎力支持下，现已建成圆通宝殿、荷花池、地藏王阁、药师佛阁、慈云宫、钟鼓楼、僧舍、客房、斋菜馆、百步阶、芳名亭、外山门等。
　　云莲寺地理位置优越，环境幽雅，背靠崇山峻岭、悬崖峭壁，左右青龙白虎夹护，前面象鼻山逶迤而来印斗朝拱，远方公平水库和红花地水库如镜辉耀。胜地嵯峨．有捧天浴日之奇。寺前茂林藏秀，流泉响奇，沿阶而上，赏心悦目。有“罗汉脚”、“金龟望月”、“木鱼朝天”等奇岩异石．自然风光雄、奇、险、幽，使人叹为观止。寺中还有玄云祖师手植的山桔和油甘树，至今300余年犹开花结果，生机盎然。并有该寺镇山之宝——玄云祖师遗传下来的汉白玉石香炉、石春臼等文物。该寺主殿圆通宝殿供奉准提菩萨，左右侧殿各供奉药师佛和地藏王佛像。现聘请广东佛教协会会长释新成大和尚任方丈，省佛协副会长、大佛寺释耀智大师任首座。